Jonathan har bidratt til forskningsarbeid med fokus på strukturelle og nevrologiske forhold i det kraniocervikale området. Arbeidet inkluderer blant annet analyser av objektive måleparametere som holdning, bildediagnostikk og nevrofysiologiske data.
Formålet med forskningen er å undersøke hvordan presis analyse av struktur og funksjon kan bidra til bedre klinisk vurdering, spesielt hos pasienter som tidligere har vært utredet uten klare funn eller tilfredsstillende fremgang.